Das Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF) hat Mitte Januar 2009 die zweite Wettbewerbsrunde gestartet. Die fünf Spitzencluster haben in besonderer Weise dem Grundgedanken des Wettbewerbs Rechnung getragen.
In der zweiten Runde des Spitzencluster-Wettbewerbs sind insgesamt 23 Bewerbungen eingegangen, die von einer unabhängigen Jury unter Vorsitz von Prof. Dr. Dr. Andreas Barner, Sprecher der Unternehmensleitung der Boehringer Ingelheim GmbH, bewertet wurden. Aus diesen Bewerbungen konnten sich 10 Cluster für die entscheidende Auswahlrunde durchsetzen, aus denen im Januar 2010 fünf Spitzencluster von der Jury zur Förderung ausgewählt wurden. Die Gewinner der zweiten Wettbewerbsrunde haben die Jury durch ihre strategischen Konzepte, ihre Leistungsfähigkeit und die maßgebliche finanzielle Einbindung von Wirtschaft und privaten Investoren klar überzeugen können.
Die Spitzencluster der zweiten Wettbewerbsrunde sind: